\section*{Acknowledgments}
Je remercie: Magali qui fut toujours \`a mes c\^ot\'es durant les moments les plus difficiles et sans qui cette th\`ese n'aurait vu le jour, Barry for his excellent and wise supervision, mes parents et ma soeur pour leur soutien constant et leur confiance en moi, George and Ciar\'an for all the good times during those past four years et finalement l'{U}nion europ\'eenne\footnote{The work presented in this thesis was funded by the ESIGNET project (Evolving Cell Signalling Networks \textit{in silico}, a European Integrated Project in the EU FP6 NEST initiative, contract no. 12789).} pour avoir financ\'e mon doctorat. 